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アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

「QuickGWAS Academic」バージョンアップしました

表題にありますように、遺伝統計解析ソフト「QuickGWAS Academic」がバージョンアップ(→1.2.3)しました。 フリーのGWASソフトである「PLINK」のWindows版ラッパーソフトである「QuickGWAS」シリーズですが、独自の機能として、統計解析パッケージ「R」を利…

GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」の不具合につきまして

GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」をご利用いただきありがとうございます。 Windows XPにおきまして、「plink.exe」もしくは「Rscript.exe」のパス内に「スペース」を含む場合に、動作しない不具合を確認いたしました。 ご迷惑をおかけしておりますこと…

QuickGWAS Academic

2週にわたって、SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」のお話をさせていただきました。 もっと詳しく知りたい方は、チュートリアルをご覧いただくか、弊社ホームページのお問い合わせフォームよりご連絡ください。 機能を充実させた「QuickGWAS Pro.」…

QuickGWAS Academic「Plot」

先週から、SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」を使用しています。解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。 今日は、GWASの結果をPlotして可視化します。 step1 「Plot」タブを選択します。 step2 「.assoc.plot.txt」ファイルを指定します…

QuickGWAS Academic「GWAS 2」

SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」を使用して解析を行います。 解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。 前回は、GWASを行いました。 GWASが成功すると「GWAS End」ウィンドウが表示され、サンプル数が表示されます。 結果は、BEDファイル…

QuickGWAS Academic「GWAS」

SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」を使用して解析を行います。 解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。 Preparationが完了したら、GWASを行います。 step1 「GWAS」タブを選択します。 step2 「.bed」「.bim」「.fam」ファイルを指定しま…

QuickGWAS Academic「Preparation」

SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」のSettingが済んだら、さっそく解析を行います。 解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。 Preparationでは、PED/MAPファイルから、バイナリーファイル(BED/BIM/FAM)を作成します。 step1 「Prepara…

QuickGWAS Academic「Setting」

SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」のダウンロードが済んだら、さっそく使ってみましょう!!まずSetting作業を行います。 step1 「QuickGWASAcd_(バージョン番号).exe」をダブルクリックして起動します。 step2 「Setting」タブを選択します。 st…

QuickGWAS Academic「ダウンロード」

今日は、SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」のダウンロード方法についてお話します。 step1 アメリエフ株式会社の「QuickGWAS Academic」ページを開きます。 URL: http://amelieff.jp/service/software.html step2 「QuickGWASAcd_(バージョン番号…

QuickGWAS Academic「機能 2」

SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」の機能を、もう少し詳しくお話します。 1.case/control関連解析 3種類のファイルと、MAFおよびHWEを指定します。 実行ボタンをクリックすると解析が行われます。 結果は、テキストファイルで出力されます。Exce…

QuickGWAS Academic「機能」

今週は、SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」のお話をします。 教育・研究機関の方は無料でご利用いただけますので、是非お試しください。 「QuickGWAS Academic」は、ゲノムワイド関連解析ツールセット「PLINK」のWindows版GUIインターフェースです…

「QuickGWAS Academic」バージョンアップのお知らせ

SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」(無料版)をバージョンアップいたしました。(-> Ver. 1.1.0) ダウンロードページはこちらです。 http://amelieff.jp/service/software.html

「QuickGWAS Academic」リリースのお知らせ

ゲノムワイド関連解析ソフト「QuickGWAS Academic」を本日リリースしました。 「QuickGWAS Academic」は、ゲノムワイド関連解析ツールセット「plink」のWindows版GUIインターフェースです。PCにインストールしてご利用いただけます。 ケース・コントロール関…