アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

次世代シーケンサーSOLiDのデータ解析

次世代シーケンサーの一つ、ライフテクノロジーズのSOLiDのデータ解析をしています。

オープンソースの解析ソフトは多数公開されていますので、そのソフトをつなぎ合わせて目的の解析をするパイプラインを構築するのですが、そのパイプラインの途中に組み込む解析ソフトやファイル書式のコンバーターなどが存在しない場合は(存在しない場合が多数ですが・・・)、ソフトウェアを自前で作成しています。

今日は作成したソフトウェアをお客様にプレゼンしました。数千万のデータから目的の情報を抽出することは通常のパソコンでは困難なので、専用ソフトを作成しているわけですが、お客様は抽出された結果(統計処理した結果)を初めて見て、予想外の結果に驚いていました。

研究上は新たな課題の出現ですが、ソフトを作成した弊社としては研究に貢献できた喜びを味わっています。(笑)