SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」を使用して解析を行います。
解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。
前回は、GWASを行いました。
GWASが成功すると「GWAS End」ウィンドウが表示され、サンプル数が表示されます。
結果は、BEDファイルと同じフォルダ保存されます。
「.assoc.txt」ファイルには、1.0e-04未満のSNPが保存されています。
Excel等で開くことができます。
「.assoc.txt」のカラム
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「QuickGWAS Academic」のQuickGWASAcd_1.1.0.zip Version 1.1.0 (update: 2011/01/17)をクリックしてください。
