読者です 読者をやめる 読者になる 読者になる

アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

QuickGWAS Academic「Plot」

先週から、SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」を使用しています。解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。
今日は、GWASの結果をPlotして可視化します。

step1
「Plot」タブを選択します。
step2
「.assoc.plot.txt」ファイルを指定します。
GWAS実行後は、自動的にファイルが選択されます。
step3
「make plot」ボタンをクリックすると、Q-Qプロットとマンハッタンプロットを描画されます。
step4
「.assoc.plot.txt」ファイルと同じフォルダに、「.qq.png」と「.manhattan.png」ファイルが作成されます。


【ダウンロードページはこちら】
「QuickGWAS Academic」のQuickGWASAcd_1.1.0.zip Version 1.1.0 (update: 2011/01/17)をクリックしてください。