読者です 読者をやめる 読者になる 読者になる

アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

ゲノムブラウザのご紹介「IGV 2」

以前IGVについて、少しだけ紹介しました。
今日からは、GWASの解析結果をIGVで見てみましょうというテーマで書いていきます。
次世代のデータに関しては、おいおい説明させていただくということで・・・
大まかな流れは下記のとおりです。

■IGV(Integrative Genomics Viewer)
IGVをダウンロード
http://www.broadinstitute.org/software/igv/
■Java
Javaをインストール
http://www.java.com/ja/
■入力ファイル作成
使用したフォーマットは「CN File Format」
http://software.broadinstitute.org/software/igv/CN
■IGVで表示