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アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

IGV「igvtools 4」

今日は、IGV(Integrative Genomics Viewer)のigvtoolsについてご紹介したいと思います。
まず、sort機能を使って、start positionで並び変えます。
対応しているファイルは下記の通りです。
.cn, .igv, .sam, .aligned, .psl, .bed, and .vcf
IGVからigvtoolsを起動させます。
Commandから「Sort」を選択します。
Input Fileの「Browse」をクリックしてファイルを選択します。
すると自動的に、Output File欄にファイルの場所と名前が入力されます。
良ければ「Run」をクリックします。

Messagesに「Done」と表示されれば完了です。