アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

BEDTools 1

今日は、BEDToolsを簡単にご紹介いたします。
URL:http://code.google.com/p/bedtools/
BEDToolsは、NGSのデータ解析で役に立つツールです。

まず、bamToBedを使って、BAMファイルをBEDファイルに変換する作業をしてみましょう。
igvで表示すると下記のようになります。
SRX033211.sorted.bedという灰色で表示されているファイルが、
作成したBEDファイルです。

折をみて、詳しい説明をしていきたいと思います。