アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

BEDTools 3

以前、BEDToolsについて簡単にご紹介しました。
「BEDファイル」とはどんなファイルなのか、続きを書きたいと思います。

ファイルに記入できる情報以下の通りです。
1.chrom
2.chromStart
3.chromEnd
4.name
5.score
6.strand
7.thickStart
8.thickEnd
9.itemRgb
10.blockCount
11.blockSizes
12.blockStarts

最初の3列は必須の情報です。
向きを指定したい場合は6列目まで、色を指定したい場合は9列目まで入力する必要があります。