本日は、QuickPrimer Lite(以下、当ソフト)のTandem機能について記述致します。よろしくお願いいたします。
Tandem機能につきましても、以前弊社ブログにて紹介させていただきました。
図1 Tandem機能イメージ図
図1のように広範囲に渡るTarget領域をシーケンシングする場合、複数のprimerを一部オーバーラップさせて設計する必要があります。当ソフトでは、Target領域のstart位置（Target start position）とend位置(Target end position)を設定して頂くことで、広範囲なTarget領域に対応した複数のprimerを設計することが可能です。
操作方法
1. QuickPrimer Liteを起動させます。
2. primer3.exeおよび.csv ファイルの保存先を設定
昨日のブログ(Target編)を御参照ください
3. 各項目を設定
tandemタブ画面を表示し、下記の項目を設定します。
図2 Tandemタブ画面
? SEQUENCE
昨日のブログ(Target編)を御参照ください
? 各種設定
“Target start position”、“Target end position”、“Overlap size”が、図１のTarget Start position、 Target end position、Overlap sizeに対応します。
※“Overlap size”とは、増幅されたprimerのend側の領域と次のprimerのstart側の領域が重なる領域のサイズを指します（図１参照）。
4. 実行ボタンを押す
5. 結果は、CSVファイルで保存されます
結果は、forward(F)、Reverse(R)の情報に分かれており、それぞれ、配列、primerの長さ、primerの位置、GC%、Tm、増幅させる領域のサイズが表示されます。
