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アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

連鎖解析フリーソフトMerlin

SNP解析

先日、連鎖解析の為のフリーツールソフトが紹介されているサイトを御紹介させていただきました(参照)。
本日は、その中からMerlinというソフトを紹介させていただきます。
よろしくお願いします。

Merlinは、家系データを用いてパラメトリック解析、ノンパラメトリックス解析、量的形質の関連解析、IBDと家族推定、ハプロタイピングなどを行う事ができます。
Merlinには、exampleデータが付属されており、tutorialで解析の練習を行う事も可能です(これは私的に大事なポイントです)。

ダウンロードはこちらから

下記からは、linux上でMerlinを実行方法を記述していきます。

上記のサイトからmerlin-1.1.2.tar.gzをダウンロードし、解凍を行います。
解凍コマンド
tar zxvf merlin-1.1.2.tar.gz

その後、merlin-1.1.2ファイル内でmakeコマンドを用いて、コンパイルを行います。
さらにmake installをタイプします。


merlinとタイプしてみましょう。


MERLIN 1.1.2 - (c) 2000-2007 Goncalo Abecasis
References for this version of Merlin:
Abecasis et al (2002) Nat Gen 30:97-1




の様に表示されました。
merlinが使用できます!
準備完了!