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アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

RepeatMaskerViz.トラックがかっこいい

UCSC Genome Browserの「GRCh38/hg38」にかっこいいトラックを見つけたのでご紹介します。
「RepeatMasker Viz.」というトラックです。

下図の上がRepeatMaskerトラック、下がRepeatMasker Viz.トラックです。

RepeatMasker Viz.はRepeatMaskerを視覚的に表示したトラックです。

矩形の部分はゲノムにマップできる部分、破線の部分はマップできない部分で、リピート中のInDelも表示できます。

Repeatの様子が理解しやすくていいですし、数字の入れ方など見た目がなんかかっこいいです。

詳しくは Repeats -> RepeatMasker Viz. のヘルプをご覧ください。