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アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

Somatic SNV検出編

次世代シーケンサー解析

2014年6月21日に開催した、アメリエフ株式会社・第33回バイオインフォマティクス勉強会の「フリーソフトではじめるがん体細胞変異解析入門」のスライドをSlideShareにて公開いたしました。
主に、ブログでもご紹介したことがあるソフトウェアSomaticSniperをつかった解析のご紹介です。昨年の日本癌学会学術総会でもポスターで発表しました。



なぜわざわざ体細胞変異解析に特化したソフトウェアを使用するのか、どんな点に注意して実験・解析を行うのかについて説明しています。
また少しですがCNV検出にも触れています。
みなさまの解析のご参考になりましたら幸いです。