アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

第51回バイオインフォマティクス勉強会

第51回バイオインフォマティクス勉強会レポート! 「微生物ゲノム解析事始め〜シーケンス外注から論文化まで!〜@東京」手軽に使える原核生物ゲノムオートアノテーションツールDFASTなどを紹介しました。

bcftools queryでVCFから情報を抽出する

bcftools queryを使うと、VCFまたはBCFから、任意の形式で列を抽出して出力することができます。例えば好きな列だけ拾ってタブ区切りテキストに。めちゃ便利! 最後に読者への挑戦(?)もあるよ

「第3回ヒューマノームゼミ 〜 徹底活用!ゲノム医療!」で、ゲノム医療の社会実装について発表しました!

先日、10月29日(木)に、株式会社ヒューマノーム研究所主催「第3回ヒューマノームゼミ 〜 徹底活用!ゲノム医療!」が開催されました。 今年6月から「がんゲノム医療」を対象にした保険適用が始まり、日本中から集められる遺伝子情報や診療情報のビックデー…

受託解析サービスに新ラインナップを追加しました!

アメリエフでは、下記の解析サービスを開始いたしました。 ■ tandem repeat解析 ロングリード(PacBio、Oxford Nanopore)データから、Tandem repeat数を算出します。Reference repeat countsからのズレにて報告します。 ■ Chromiumを用いたV(D)J解析 Chromi…

misawatの「適度にGASを使う」②

GASを書くときの自分ルールの紹介をします。 GASの基本的な使い方の解説もしました。

今日は「★★★★」記念日!

こんにちは、yama_toです! 実は私、アメリエフのオウンドメディア全般の更新を行っているのですが、管理用アカウントで作業しているため、自分自身の「yama_to」アカウントでは久々の更新となります。 確認してみたら、 2018年11月29日の記事1本のみでした(…

Hello world! コンピュータからメッセージ!?

スマートフォンとおしゃべりできる時代... 私の仕事で使うサーバもあいさつくらいしてほしい! 軽い気持ちで .bashrc をいじってみたらscpをめぐる戦いが始まった...?!