edgeR を用いたRNA-seq の発現比較において比較群を定義する時のポイント。これがコントロール群、あれが比較群だよ、とバッチリ指定しましょう!【コマンド例あり】
NGSデータを用いた研究にあたり、測定や解析を内製化するか、外部委託するかはポイントになります。こんな方にオススメ・利用例を公開!
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Volcano plotを描くために、SeuratのFindmarkers() 関数のオプションを少し工夫します。
16S rDNA メタゲノム解析で使われるデータベース、SILVAとgreengenesの違い
Rパッケージ "ReactomeContentService4R" の getPathways() 関数を使って、Reactome Pathwayの最上位のPathway名を検索する。