アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

2015-02-02から1日間の記事一覧

bamにread groupを追記する

GATKは、BAMのフォーマットに厳しく(参照ページ)、たとえばヘッダにサンプル名を含むread groupのリストがあり、かつすべてのリードがそのread groupに属しているBAMしか受け付けません。 Read group(以下RG)は、たとえばBWAではマッピングのときに -R …