こんにちは。Windowsユーザの筆者です。今週のお題「オンライン」にのっかって、初めてMacPCからサーバにssh接続するまでの思い出話。
新成人の皆様へ
R環境だけで解決する問題ではなかったんです。
これまで生物学に馴染みのなかった方が、バイオインフォマティクスの前提知識を身に着けられるサイトをご紹介します。さあ貴方もバイオインフォの世界へ!
昨今と未来のロングリード情勢について少々
クロマチンアクセシビリティを細胞レベルで明らかにする、今をときめくシングルセルATAC-seq。現在どんなDRY解析が行われているのでしょうか?
6月から8月初めまで、アメリカからインターン生が来てくれていました。 短期間で様々な仕事をこなし、大いにスキルアップして、この度インターン期間を無事終えた彼女に、感想を伺いました!
古くからの友達に久々に会うと嬉しくなりますね。 地元の幼馴染、高校の友達、サークル仲間、そして人類の太古からのお友達であるミトコンドリア。 DRY解析だけやっていると絵や写真でしか会えない彼ですが、最近、その解析中に会えたのです。 「?????…
ネットから変異データベースなどの大容量ファイルをダウンロードした時や、HDDからデータを移動した時、データ破損なくダウンロードできているか不安になりませんか? あるいは、書き換えがあっては困るデータに対して、経時的に何回も改変有無をチェックし…
こんにちは。lessのオプションの連載をしている人、miyatakeyです。 いやあ、便利ですから。どんどん活用していきましょう。 とはいえ今回ご紹介するのは、これまでのようなコマンドラインオプションとは異なります。 less自体の便利機能のご紹介です。 皆さ…
lessで開いたファイル内での特定文字列(ex. hoge)の検索は、' /hoge 'と打てば可能です。 便利なのですが、queryの大文字小文字がきっちり区別されてしまうことには少々不便さを感じていました。 例えば、アノテーション情報付きVCFから特定データベース由…
バイオインフォマティクス業界に飛び込んでもうすぐ3カ月のmiyatakeyです。最近大いに思うことがあります。 VCF等をlessで見る時、画面端で行が折り返されて見にくい。INFO列は親の仇。 見やすくできないかと思い調べてみました。lessのオプションで解決です…
こんにちは、miyatakeyです。 去る5/29、「 IT x バイオ」を掲げるベンチャー5社と学生さんとの出会いイベント、東京バイオベンチャーズ主催「2019年新卒&インターン学生MeetUp vol.2」に参加しました。 前半は企業からの情報提供のターン。各社代表により…
ゲノムの解析においては、snpEffによるannotateなど時間のかかる計算というのがしばしばでてきます。その最中、プログラムが本当に走ってくれているかリアルタイムに監視したい、ということがままあります。topコマンドをはじめプロセス監視用コマンドは数種…
入社し日常的にlinuxを使い始めて1カ月半が経ちました、miyatakeyです。 目下の目標は「カーソルキーからの卒業」です。コマンドラインやvimで、カーソル移動にはついカーソルキーを触ってしまいます。ですが一行が長いことはざらですから、効率アップにショ…
こんにちは。「自分の知識や主張を、知らない人に説明する」ということに学生時代から四苦八苦しているmiyatakeyです。 極めようとすれば一生モノのこのテーマ、お悩みの方は多いのではないでしょうか。 今回はそんな人々で上達法を共有すべく、私の思うお役…
こんにちは、miyatakeyです。 この時期、街では就活生の方をよく見かけます。私も去年は就活中でした。 そこで今回はそんな方々宛てに、私が就活を経た今感じる、会社選びについてのお話をしたいと思います。ご参考までに。 さて、突然ですが皆さん、良い会…
はじめまして!2018年4月に入社しました、miyatakeyです。 生まれも育ちも東京ですが、ゼロ歳から毎年家族旅行している長崎を第二の故郷に思っています。 好きなことは料理と気まま散歩で、和菓子に目がありません。 大学での専門は細胞生物学です。植物(シ…