シーケンスリードをゲノムにマッピングしたあと、カバレッジやデプスなどを簡単に確認する方法を紹介。samtoolsを使います。

SSH接続のタイムアウトを防ぐ

Rを使って、発現マトリックスに遺伝子の色々な情報を追記します。

Biopythonを使った「配列アライメントの実行」と「分子系統樹の描画」を紹介します💫

NGSデータから取得した変異データ(VCF形式)をGWAS解析のPLINKに読み込みます。

Windows PCのコントロールパネルを見やすくする

BAM/SAMファイルのヘッダーにある項目のひとつ「PP」タグについて説明します。エラー対処法も。

LInuxのsedコマンドでbedファイル内の染色体名を変更する方法

がん細胞のシングルセルRNA-seq データからCNV コピー数変異を予測するプログラムの紹介です。図の見方も説明。

Rの%in%演算子とmatch関数について紹介します

linux サーバーのユーザーアカウントを、パスワード認証で一時的にログインできなくさせる術

VCFを分析できるPythonモジュール・cyvcf2の紹介です⭐️

Macのトラックパッドで英単語を検索

Windows PCを使ってサーバに接続してみよう

pythonの`import`を用いると、パッケージを読み込んで様々な関数を使えます。 自分で定義した他のpythonプログラムもimportできます。長いプログラムを書くときや、機能別にファイルを分けたいときに便利！

自己紹介 (tsuyuh)

2021年に新卒入社したadachitの自己紹介

DNAの変異を検出するReseq解析の最新レビューを紹介。（筆・インターンtsuyuh）

Linux入門講座でよくいただく質問「どこにどんなディレクトリを作ったかわからなくなっちゃったら，どうしたらいいですか？」にお答えします^^

Bowtie2のdovetail機能

アメリエフ株式会社 CTO 退職のご挨拶

新しい理療や新薬「開発」における、現場のニーズを叶えていく 取締役COO 金：エンジニアのマネージャー募集を始めた背景を教えてください。 代表 山口：アメリエフは創業から一貫して、生命科学研究のデータ解析を通して研究成果を生み出すことや、研究成果…

CUT&RUN-seqをご存知ですか。 メリット、解析上の注意点を紹介します。（執筆・インターン生hattorit）

社員たちの会話＠マスクランチ会

新年明けましておめでとうございます。本年もどうぞよろしくお願いいたします。 さて、2021年1月22日 (金) 開催の、セルシグナリングテクノロジージャパン株式会社、タカラバイオ株式会社 、アメリエフ株式会社による合同オンラインセミナー「CUT&RUNによる…

旧年中は格別のお引き立てをいただき、誠にありがとうございました。 特に旧年は、コロナ禍のため思うようにご研究ができなかった研究者の方もおられたかと思います。 弊社では今後もオンライントレーニングなど、時代に合わせたサービスを提供することで皆…

2020年を振り返ります。人材と、新しい技術やサービスが思い出されます。

アメリエフ社員の日常ブログ。引越しと保育園の転園を語ります。意外な制度があって預け先なしの危機も！？

海外の大学院を受験するという元インターンシップ生に推薦状を書きました。

日本分子生物学年会にて、入門者向けのセミナーを行いました（ででん！） 年会に参加登録した方は2021/01/29 まではアーカイブとしてご覧いただけます。