アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

国際ゲノム会議に参加しました ②クロマチン・シングルセル

2019年6月25日〜27日に行われた 第13回国際ゲノム会議に社員が参加いたしました。 レポート記事第二弾は、クロマチンの立体構造解析と、シングルセル解析のこれから!

国際ゲノム会議に参加しました ①バイオバンク・データベース

2019年6月25日〜27日に行われた 第13回国際ゲノム会議に社員が参加いたしました。 レポート記事第一弾は、UKの研究者が紹介するバイオバンク・データベースの取り組み。-omicsデータの蓄積も進み、データの活用が期待されます。

第49回バイオインフォマティクス勉強会「NGS解析基礎知識~頻出データフォーマットとExcelを用いたサマライズ@東京~」開催のお知らせ

アメリエフは、7月19日(金)に「NGS解析基礎知識~頻出データフォーマットとExcelを用いたサマライズ@東京~」というテーマで第49回バイオインフォマティクス勉強会を開催いたします。 詳しくはこちらの記事をご覧ください amelieff.jp

第48回バイオインフォマティクス勉強会を開催しました

第48回バイオインフォマティクス勉強会を開催しました! 第一部のテーマは「NGSデータ解析ステップアップ勉強会」 第二部のテーマは「クラスタコンピューティングのバイオインフォへの応用」

Trinityのインストール

de novo transcriptomeアセンブリングツール "Trinity"のインストール方法完全版! Trinityの名前の通り、大きく三つのアルゴリズムでできています。

お祝いランチ無料です!インターン生・アルバイトさんの入社を歓迎する「お祝いランチ補助制度」スタート

アメリエフでは、入社の緊張をできるだけ早く解いていただくため、5月より「お祝いランチ補助制度」を開始しました! 詳しくはこちらの記事をご覧ください www.wantedly.com

第7回アメリエフオープンセミナー開催のお知らせ!

アメリエフは、8月15日(木)に「臨床遺伝医、臨床検査医、消化器内科医としての経験から考えるがんの遺伝子診療」というテーマでオープンセミナーを開催いたします! 本セミナーでは、遺伝子解析の結果について解釈を行いゲノム医療を実践されている、浜松…

メチル化アレイをIGVで可視化する

アレイデータとNGSデータをIGVで並べたい 最近、メチル化アレイのデータをNGSデータと並べて見てみたいから、IGVで可視化できないかと相談を受けました。 日頃、様々なツール間でデータをやり取りするためにファイルを変換するスクリプトをよく書いているの…

データ解析でほっこりした話

古くからの友達に久々に会うと嬉しくなりますね。 地元の幼馴染、高校の友達、サークル仲間、そして人類の太古からのお友達であるミトコンドリア。 DRY解析だけやっていると絵や写真でしか会えない彼ですが、最近、その解析中に会えたのです。 「?????…

【体験談】CTOに誘われてインターンしたら、やりたい仕事がみつかった!

インターン生インタビュー第4弾です。 詳しくはこちらの記事をご覧ください www.wantedly.com

ランチタイムに、ウズベキスタン入門!

こんにちは、広報の山本です! 今日のランチタイムの自主勉強会は、「中村博士の観光学〜ウズベキスタン入門〜」! ゴールデンウイークの10連休を利用して訪れた、ウズベキスタンの思い出を共有していただきました。 講義では、ウズベキスタンの言語や宗教な…

株式会社ジーンクエスト社主催「創薬分野向け最新ゲノム研究会」で代表の山口が登壇します!

2019年7日9日(火)の「創薬分野向け最新ゲノム研究会」に代表の山口が登壇いたします。 4社の企業が集まり、バイオベンチャーの研究事例や、バイオベンチャーと企業が協力し、どのような共同研究が可能なのか、についてご紹介いたします。 詳しくはこちらの記…

single cell RNA-seqで、アイソフォーム解析!

bulk RNA-seqでできる解析が、どんどんシングルセルRNA-seqでもできるようになっています。 シングルセルの全長RNAシーケンシング・解析をご紹介!アイソフォームや融合遺伝子の解析に。

BAMファイルの切り取り bedtools intersect ? samtools ?

bamファイルから一部の領域を切り取るときはbedtoolsを使うことが多いですが、ほしい領域が1箇所〜少ない場合はsamtoolsが手軽&高速です。 ツール豆知識シリーズ・新作!(?)

アメリエフ株式会社広報Twitterを開設しました!

アメリエフはこの度、アメリエフ株式会社広報の公式Twitterを開設いたしました。 詳しくはこちらの記事をご覧ください https://amelieff.jp/190525/

第6回アメリエフオープンセミナー開催のお知らせ~疾患ゲノム解析:解析手法と解析対象を再考する

「疾患ゲノム解析:解析手法と解析対象を再考する」というテーマで、6月27日(木)にオープンセミナーを開催いたします! 本セミナーでは、医師として遺伝性希少疾患を対象とした医学研究に取り組まれている、大阪大学大学院 宮下 洋平 先生をお招きし、遺伝…

社員20名弱のベンチャー企業でテレワーク勤務を実験してみたら、オフィスが恋しくなった!?

アメリエフでは、今年4月から「テレワーク勤務制度」がスタートしました! 制度開始前の2月に、テレワーク勤務による業務への影響やトラブルがないかを検証するため、全社員が実際に1日テレワーク勤務してみました。 詳しくはこちらの記事をご覧ください www…

第8回超異分野学会トークセッション、未来の医療やデータ・ドリブン研究について熱くディスカッション!

アメリエフが主催させていただいたトークセッションの模様をお届けします。 詳しくはこちらの記事をご覧ください www.wantedly.com

第4回&第5回オープンセミナーを開催しました

第4回&第5回オープンセミナー振り返り!

第48回バイオインフォマティクス勉強会「データ解析とは切り離せないプログラミング技術について@東京」開催のお知らせ

アメリエフは、5月28日(火)に「データ解析とは切り離せないプログラミング技術について@東京」というテーマで第48回バイオインフォマティクス勉強会を開催いたします。 詳しくはこちらの記事をご覧ください https://amelieff.jp/190426/ amelieff.jp

UniDB(ユニバーサル データベース)のデータベースを更新しました!

UniDB(ユニバーサル データベース)のデータベースを更新しました! 世界的に公開されている様々な集団のゲノムバリエーションや、変異と表現型(疾患や薬剤応答)など、10 種以上のデータベースをアメリエフ独自に統合したUniDB(ユニバーサル データベー…

ランチタイムの自主勉強会第二弾は「中村博士のよく分かる現代魔法少女学」!?

こんにちは、広報の山本です! 先日、ランチタイムの自主勉強会の第2回目が開催されました。タイトルはなんと、「中村博士のよく分かる現代魔法少女学」・・・。会社アカウントで紹介してよいの?!と迷いながら、上司にこの記事の承認を頂いております(笑…

ランチタイムに”宇宙”について自主勉強会!

こんにちは、広報の山本です! 先日ブラックホールの撮影に成功したというニュースがありましたが、それについてランチタイムに「ブラックホール概論〜写真が取れたからなんなのか〜」というタイトルで、宇宙物理学専攻で博士号を取得しエンジニアとして活躍…

Single Cell RNA-seq解析で使用されるプロトコルのご紹介

お久しぶりです。kimotonです。 今回はSingle Cell RNA-seq技術のうち、代表的なプロトコルについてご紹介します! レッツシングルセル!

Rスクリプトで図を描画

Rで作図するとき、コマンドを一つ一つ打つと出来るのに、Rスクリプトを実行するとうまく描画できないこと、ないですか? Rスクリプトでも問題なく描画するルール2選!

Rスクリプトの使い方

長いコマンドを打つときや、 同じコマンドを繰り返し実行するときは、スクリプト(ファイルに書いておいたコマンド)を使うと便利です。 Rでスクリプトの使い方、2選!

第5回アメリエフオープンセミナー「シングルセルRNA解析の始め方:サンプル調製からデータ解析まで」開催のお知らせ!

4月18日(木)に「シングルセルRNA解析の始め方:サンプル調製からデータ解析まで」というテーマでオープンセミナーを開催いたします! 本セミナーでは、シングルセルRNA解析を始めるにあたり、留意する点や研究の始め方について、製品やサービスを提供する1…

【新聞】日本経済新聞社「日本経済産業新聞」にて三重大学医学部附属病院に採用された遺伝子検査支援システムAmeliCure(アメリキュア)について掲載されました!

日本経済産業新聞にて、三重大学医学部付属病院に採用された遺伝子検査支援システムAmeliCure(アメリキュア)について掲載されました! 詳しくはこちらの記事をご覧ください amelieff.jp

CTOに聞いてみた「開発に力を入れる」とは?~バイオインフォマティクスの敷居を下げるプログラムを目指して!

弊社CTO三澤に開発への想いをインタビューしました。 詳しくはこちらの記事をご覧ください www.wantedly.com

ベンチャー新卒入社~この1年でタイムマネジメントの大切さに気づいた

アメリエフに2019年4月に新卒入社してくださった木本さんに、どんな1年だったのかインタビューしてみました! 詳しくはこちらの記事をご覧ください www.wantedly.com