アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

ちょっとした本

今回は学生から初学者向けにちょっとした本をご紹介します。

オンラインセミナー「DX×生命医療データ活用入門」開催のお知らせ

IoT技術やICT技術の発展によってデータが収集、蓄積、解析、統合され、情報を知織化をして、産業の活性化や社会問題の解決に役立てるSociety 5.0社会の実現が内閣府主導で進められています。特に、近年生み出されるようになった新しいタイプの生命医療データ…

【プレスリリース】解析システム開発がグラフィカルユーザインタフェースに対応しました

アメリエフ株式会社(本社:東京都墨田区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ) は、解析システム開発のグラフィカルユーザインタフェース(Graphical User Interface、略称:GUI)への対応をお知らせします。 詳しくはこちらの記事をご覧ください amel…

【プレスリリース】解析受託サービスメニューをリニューアルしました

アメリエフ株式会社(本社:東京都墨田区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ)は、バイオインフォマティクス技術を用いた解析受託サービスのメニューをリニューアル致しましたのでお知らせします。リニューアルによって、トレンドの手法を加え体系化し…

バイオインフォマティシャン的視点でPythonの組み込み関数について考えてみた

Pythonコーディング新2年生のアメリエフ社員が厳選する、Python組み込み関数3選✨

【レポート】高校3年生から修士1年生対象 第2回「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催しました!

9月5日(土)に、「次世代未病予防のための遺伝子解析超入門 ーバイオインフォマティクス×Society 5.0ー」というテーマのもと、「第2回 課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催いたしました。 当日は、医学、理学を専攻されている学生さんを中心に…

リシーケンス解析でのPCR duplicateの扱い

本日のテーマはPCR duplicateの除去について。とは? なぜするの?

misawatの「適度にGASを使う」④

misawatの「適度にGASを使う」シリーズ最終章。

アニバーサリー休暇制度を使って、七五三の前撮りへ!

こんにちは、yama_toです。アメリエフで今年よりスタートした「アニバーサリー休暇制度」を使って思い出の1枚を撮影に行ってきました⭐️

【9/10開催】第9回アメリエフオープンセミナー「Society 5.0社会に向けたバイオデータ活用」のお知らせ!

アメリエフでは、最先端の研究に取り組まれている様々な分野の先生をお招きし、お取り組みについてご紹介いただき、NGSデータ解析を取り巻く情報の共有の場を作ることで、日本全体の研究力の底上げに尽力するため、定期的にオープンセミナーを開催しています…

梨とソーシャルディスタンス

「梨のソーシャルディスタンス」植物にも病気があり、ディスタンスは重要なんです

Dockerとストレージと私

最近Dockerちゃんと仲良くなろうと奮闘中の筆者に、事件が発生?!ドタバタお掃除コメディです🧹💫

Bioinformatics×Society 5.0 バイオエコノミーとは?【役員対談】

Society 5.0時代にアメリエフが目指すこと、について第2回目の役員対談をおこないました。 ご興味があれば、是非ご一読ください。 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

【プレスリリース】高校3年生から修士1年生を対象に 第2回「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催!

アメリエフは、高校3年生から修士1年生を対象に「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を、9月5日に開講いたします。 第2回目のテーマは「未病予防のための遺伝子解析超入門 -バイオインフォマティクス×Society 5.0-」です。 ご参加をお待ちしており…

食?

食(食べる方じゃないよ!)

バイオインフォマティクスをリモート講義で学習💻実際どんな感じ?

バイオインフォマティクスのトレーニングがオンラインに対応しました。本記事ではお客様目線でその流れをレポートします!

misawatの社員褒め殺しシリーズ①

技術部のなんちゃってトップであるmisawatがひたすら部下をほめます。 記念すべき第一回は、アメリエフブログの管理者でもあるゆるふわ氏です。

腸内古細菌っているの?

先日、16S rRNAの記事を書かせていただき、そこでもちょっと触れたのですが、 16S rRNAってRNAなの? - アメリエフのブログ 学生のころ、生物は(真正)細菌、真核生物、古細菌(アーキア)の3つに大別できる(3ドメイン説)と習ったので、『腸内「細菌」叢って…

サーバ間のファイル転送を手軽に!【.ssh/config ②】

scpコマンドって、ユーザー名指定して、IPアドレス指定して...ってコマンド長い!!そういう時も、.ssh/configが使えるんです😊 所要時間は1分⏱

PLINKで可能なファイル形式の変換

SNP解析をしていると、いろいろなソフトウェアでいろいろな形式のファイルが必要になってきますよね。 だいたいPLINKがどうにかしてくれます。

【sudo】rootパスワードを知らなくて困った話【su】

フットボール⚽️のリーグがおわり、観戦による寝不足から開放された筆者がお送りします! sudo とsuコマンドについて詳しく調べてみました🖥(取り扱い注意!)

マネージャーに聞いてみた、アメリエフのシステム開発の強みとは?

アメリエフには、データ解析やコンサルティングを担うライフサイエンス事業部と、システム開発を担うメディカルシステム事業部があります。 今回は、お客様からのご依頼のほか、自社製品開発や社内システムを担うメディカルシステム事業部マネージャーに、ア…

(Rで)オブジェクトの名前を文字列として取り出す。関数内でも使える

オブジェクト(変数)の名前って、ユーザにはもちろんわかるのですが、文字列として呼び出すのがけっこう難しいのです。今日はそんなやり方を紹介。関数の中に入れる場合の例も添えて! おまけ:納豆のはなし

Dockerfileを用いた初期設定:ユーザ追加

Dockerfileを用いたdockerイメージ生成、およびdockerイメージに対する設定をします。題材として、CentOS7のdockerコンテナにユーザを追加してみます。

【レポート】高校3年生から修士1年生対象 「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催しました!

6月27日(土)に開催したイベントレポートです。当日は、高校生の方や海外の学生の方まで、50名ほどの方にご参加いただきました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

Trinityを使った de novo transcriptome assembly + 発現比較

Trinityは de novo transcriptomeアセンブリングツールです。ここまでは有名(?)ですが、アセンブリ済みデータをリファレンスとして利用して、RNA-seqのマッピングや発現比較まで出来ちゃいます。

【役員対談】Bioinformatics×Society5.0 情報社会の次の社会とは?

Society 5.0時代にアメリエフが目指すこと、について役員対談をおこないました。 ご興味があれば、是非ご一読ください。 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

Macでターミナルとマウスを適度に使う 小技Best3

MacPCをターミナルのコマンド(bash)とマウスを組み合わせて操る、一流仕事術! (by "一流のほにゃほにゃ"がマイブームのブログ管理人 )

サーバへのログインを手軽に!【.ssh/config】

サーバへのログインって、ユーザー名指定して、IPアドレス指定して...ってめんどくさくないですか??そういう時は、.ssh/configを使いましょう😊 所要時間は3分⏱

joinコマンドで少し手間取った話

複数テキストファイル(表データ)をLinuxのjoinコマンドで連結する。おちいりやすい間違いとその対処も。