国際ゲノム会議に参加しました ①バイオバンク・データベース

2019年6月25日〜27日に行われた　第13回国際ゲノム会議に社員が参加いたしました。

会議のテーマ　"Genome to Health" のとおり、ゲノムやシーケンス情報を疾患の解明・治療に役立てるというテーマで、
データベースの現状や、最新のシーケンス技術を駆使した研究、今後の展望について
様々な興味深い発表が行われました。

アメリエフのブログでは、複数回に分けてレポートをお届けします。
本日は ① バイオバンク・データベースについてです。

100,000 ゲノムプロジェクトを始めとして世界をリードするUKから複数の研究者が参加され、
データベースの取り組みについての発表が行われました。

多くの研究者が解析に参加することができ、
疾患の原因となる変異を探すほか、
一部のプロジェクトでは、希少な変異がある人々に連絡を取り、詳しくphenotypeを調べることまでもできるそうです。（！！）

数値的根拠は無いのですが、発表を聞いていて、外国ではデータ提供者（参加者）の抵抗感が少ないのかなと感じました。
その理由ですが、
・個人に結果レポートが返される
・集まったデータが個別化医療や疾患研究の推進に役立つことがアピールされ知られている
などがありそうだと思いました。

研究目的によって必要なデータは異なりますが、
データベースの多くはWGS やWESといったゲノムデータのほか、トランスクリプトームや代謝産物などのデータ（いわゆる"-omics"）も有しており、
様々な次元のデータを組み合わせることで、疾患の原因となる変異をより見つけることができそうです。

他のセッションでもマルチオミクス解析の話題があり、その広がりと重要性を感じられました。弊社でも試行錯誤中ではありますが、多様なデータを活用すべく今後も力を入れていきます。

以下のデータベースが紹介されました。

100,000 genomes project： NHS England » 100,000 Genomes Project
UK National Health Serviceのデータベースです。
がんを始めとした疾患の個別化医療を目指し、将来的に医療・研究へデータの提供が行われるそうです。
TopMed プログラム： https://www.nhlbi.nih.gov/science/trans-omics-precision-medicine-topmed-program
ゲノム以外にもマルチオミクスデータを収集しています。（データが多すぎて解析が追いつかないほどだそうです。）
genes for good：Genes for Good
消費者向け遺伝子検査。こちらもtranscriptome、代謝データが集められています。
データを用いて現在は糖尿病、肥満などを対象に解析が行われています。
データ閲覧も可能です。 "Bravo"：https://bravo.sph.umich.edu/freeze5/hg38/
UK biobank and Pharma Pharma consortium： UK Biobank
製薬企業も参加するコンソーシアムで、5万人以上の参加者を目指しています。