2011-05-10 BEDTools 1 次世代シーケンサ解析 今日は、BEDToolsを簡単にご紹介いたします。 URL:http://code.google.com/p/bedtools/ BEDToolsは、NGSのデータ解析で役に立つツールです。 まず、bamToBedを使って、BAMファイルをBEDファイルに変換する作業をしてみましょう。 igvで表示すると下記のようになります。 SRX033211.sorted.bedという灰色で表示されているファイルが、 作成したBEDファイルです。 折をみて、詳しい説明をしていきたいと思います。