突然ですが、お手元になるべく厚い本をご用意ください。その本の、
第12章の、345,678〜345,680番目に登場する文字は何でしょうか?
数えたくもないですね!
では、ヒトゲノムhg19の、
第12番染色体の345,678〜345,680番目の塩基
は何でしょうか?
こちらは、ゲノムのFastaファイルに対して以下のsamtoolsコマンドを
実行することにより、簡単に調べられます。
$ samtools faidx hg19.fa chr12:345678-345680
>chr12:345678-345680
TTC
バイオインフォマティクスって本当に便利ですね。