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アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

IGV「igvtools 5」

今日は、IGV(Integrative Genomics Viewer)のigvtoolsについてご紹介したいと思います。
Tile機能を使って、大きなサイズのファイルをバイナリファイル(.tdf)に変換します。
IGVで表示するときに拡大や画面移動がスムーズになります。
対応しているファイルは下記の通りです。
.wig, .cn, .snp, .igv, .res and .gct
IGVからigvtoolsを起動させます。
Commandから「Tile」を選択します。
Input Fileの「Browse」をクリックしてファイルを選択します。
すると自動的に、Output File欄にファイルの場所と名前が入力されます。
良ければ、「Run」をクリックします。

Messagesに「Done」と表示されれば完了です。
手順は、Option以外はSort機能とほぼ同じです。