研究に役立つ！enrichplotでGO解析を視覚化する方法【其の壱】

バイオインフォマティクス 統計解析ソフトR エンリッチメント解析

GO解析結果の可視化について実践的に解説します。RNAseqデータから得られた遺伝子セットに対するエンリッチメント解析の基本から、DOSE・enrichplotパッケージを用いたRでの可視化手法まで、コマンドの意味やデータ構造の確認を丁寧に紹介。研究者が自分のデ…

【AWS】Linux コマンドで S3 を直接操作！Mountpoint for Amazon S3 の使い方

Linuxサーバ システム AWS

こんにちは、受託コンサルティングチームの hosor です。 Mountpoint for Amazon S3 は、Amazon S3 バケットを、Linux 上のディレクトリのように扱うことができるツールです。 通常、S3 とのファイルのやり取りは AWS CLI などの専用コマンド等を使う必要が…

PythonとPandas：表形式データの強力な操作術【BI入門⑤】

バイオインフォマティクス入門 Python

PythonのPandasライブラリで表形式データを効率的に操作する方法として、データ読み込み、表示、統計量取得など、データ解析の基礎を解説します。

私が読んだバイオインフォマティクス技術書レビュー【R、番外編】

統計解析ソフトR 書籍の紹介 linux

R関連の技術書を実体験を交えて紹介します。初学者向けから中級者向けまで、Rの基本操作やtidyverse、データサイエンスの実践的な内容を網羅。学習スタイルやコマンド実行の工夫にも触れ、読者が自分に合った方法で継続できるよう丁寧にまとめています。

【効率化】知っていると便利な Linux コマンド集 10 選【バイオインフォマティクス】

linux バイオインフォマティクス システム

バイオインフォマティクスで便利な Linux コマンド 10 選。ファイル破損確認、圧縮ファイル閲覧、バックグラウンド実行など、作業効率化のコツを紹介します。

Python入門：Windows上でのPython・Jupyter実行環境構築【BI入門④】

バイオインフォマティクス入門 Python

Windows上でのPythonとJupyter Notebookのセットアップや、BioPythonを導入してFASTA形式の塩基配列データを読み込む基本的な方法を解説します。

空間的遺伝子発現解析入門②

バイオインフォマティクス 空間的遺伝子発現解析

空間的遺伝子発現解析のうち、シーケンスベースの代表的なプラットフォーム (Visium, Visium HD, Stereo-seq) を解説します。