シングルセル解析
Seurat と Monocle のプロットの配色について解説
scRNA-seq解析の定番であるSeuratを使った複数のデータセットを統合する手順〜IntegrateDataとmergeによる統合の違いを解説します。
scRNA-seq解析のSeuratを使って、オブジェクトからraw countデータ・正規化データなどを選んで呼び出す方法。 難しい「slot」についても解説！
Volcano plotを描くために、SeuratのFindmarkers() 関数のオプションを少し工夫します。
がん細胞のシングルセルRNA-seq データからCNV コピー数変異を予測するプログラムの紹介です。図の見方も説明。
Rをソースからビルドしてインストール！！ （語感がルー◯柴感ある）
シングルセルRNA解析ソフトSeuratで、UMAP, tSNEなどのX, Y座標を取り出す方法です。書き出せばLoupe Browserなど他のソフトでも使えるようになります。
シングルセル RNA解析パッケージ Seuratの便利機能。FeaturePlotで、2つの遺伝子発現を重ねて可視化することができます。
ちょっと前にmiya-yさんがシングルセルATAC-seqについて記事を書いていたので便乗します。 CITE-seq解析について概要と関連ツールのご紹介。Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by Sequencing 略してCITE-seqです。
クロマチンアクセシビリティを細胞レベルで明らかにする、今をときめくシングルセルATAC-seq。現在どんなDRY解析が行われているのでしょうか？
bulk RNA-seqでできる解析が、どんどんシングルセルRNA-seqでもできるようになっています。 シングルセルの全長RNAシーケンシング・解析をご紹介！アイソフォームや融合遺伝子の解析に。
お久しぶりです。kimotonです。 今回はSingle Cell RNA-seq技術のうち、代表的なプロトコルについてご紹介します！ レッツシングルセル！
4月18日（木）に「シングルセルRNA解析の始め方：サンプル調製からデータ解析まで」というテーマでオープンセミナーを開催いたします！ 本セミナーでは、シングルセルRNA解析を始めるにあたり、留意する点や研究の始め方について、製品やサービスを提供する1…
バイオインフォマティクス・トレーニングサービスに新ラインナップ「Single cell RNA-seq解析」を追加しました！ 詳しくはこちらの記事をご覧ください amelieff.jp
シングルセル RNAシーケンスの分野で、ご相談により確実にお応えできるよう、 シングルセルのライブラリ調整を勉強してきました！
新製品「10x Genomics Chromiumデータ解析システム」をリリースしました！ 詳しくはこちらの記事をご覧ください amelieff.jp
