BEDtoolsは何かと便利なツールです。当ブログでも、intersectBedの記事のページがアクセスランキング上位になっています。。 つい最近までBEDtoolsのバージョンはずっと前にインストールした2.13を使っていましたが、先日より新しいバージョンのものを使った…

夏期休暇を頂き、地元沖縄に帰省しておりました。 なんと偶然同じタイミングで、海外から友人が沖縄に遊びに来ていたので、一緒に観光しました。こういう機会がなければ、わざわざ地元を観光することも無いので、とても有意義に過ごすことができました。 実…

Rでヒートマップ図を描く時、gplotsパッケージに用意されている色のセットを使うと、色指定が楽です。> install.packages('gplots')> library(gplots)論文などを見ていると、最近は青→白→赤が多いような気がするのは私だけでしょうか。青→白→赤は、「bluered…

特定の文字列を含む行を抜き出す便利なコマンドgrep。 最近便利に使っているオプションをご紹介します。 それは grep -c 。 grepコマンドで取得できた行数を出力してくれるオプションです。cはcountのcと覚えています。 これを知らなかったときは、grepコマ…

hg20/GRCh38が出る と浮かれていた、去年の夏。 やっと出たhg38（hg20という名前では無かった）をダウンロードして 染色体の長さやNの数を調べた 今年の正月。 それで満足してその後hg38のことはすっかり忘れていましたが、 気が付くと8月も後半。小学生は夏…

akbです。 先週の土曜日はアメリエフ京都支店から「五山送り火」を見てきました。当日は雨がぱらつき、点火への影響が心配されましたが、無事に見ることができました。後から新聞で知ったのですが、５１年ぶりに点火時間が変更されたそうです。 京都市内では…

東京は7月がお盆だそうですが、地元（新潟）は8月がお盆です。 お正月には神社で手を叩き、お盆には仏壇に手を合わせ、クリスマスにはケーキを食べる無節操な私ですが、いちおう仏教徒のつもりでおります。 実家の宗旨は曹洞宗なのですが、曹洞宗はお経が長…

寝苦しい夜が続きますが、みなさまよく眠れていらっしゃいますか。 安眠に効くという「塩まくら」がお店に売っているのを見ました。 塩が詰まった枕だそうで、塩の効果でよく眠れるそうです。 売っていた「塩まくら」は小さいのに2000円くらいして割高感を感…

初めまして 。Unyanee (アンヤー二ー) ともうします。タイから来ました。よろしくお願いします。 We have just finished Amelieff's second quater meeting. During the meeting, I had a chance to eat Unagi-don for lunch. The size of the eel was so im…

hatです。 8月第二週は、日本各地のお客様から出張トレーニングのご注文をいただきまして、5日間連続でPerlやLinuxの講師をさせていただくことになりました。 昔から、自分は人にものを教える仕事は絶対向いていないと思い、教員免許をとることなど考えたこ…