アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

python : importで自分で書いたプログラムを使おう

pythonの`import`を用いると、パッケージを読み込んで様々な関数を使えます。 自分で定義した他のpythonプログラムもimportできます。長いプログラムを書くときや、機能別にファイルを分けたいときに便利!

2021年度新入社員のtsuyuhです。

自己紹介 (tsuyuh)

2021年度新卒 adachit

2021年に新卒入社したadachitの自己紹介

Reseq解析 2021アップデート

DNAの変異を検出するReseq解析の最新レビューを紹介。(筆・インターンtsuyuh)

迷子の♪迷子の♪ディレクトリさん

Linux入門講座でよくいただく質問「どこにどんなディレクトリを作ったかわからなくなっちゃったら,どうしたらいいですか?」にお答えします^^

鳥のしっぽ

Bowtie2のdovetail機能

退職のご挨拶

アメリエフ株式会社 CTO 退職のご挨拶

最先端の技術で、創薬やヘルスケアを発展させたいエンジニア集まれ!【役員対談】

新しい理療や新薬「開発」における、現場のニーズを叶えていく 取締役COO 金:エンジニアのマネージャー募集を始めた背景を教えてください。 代表 山口:アメリエフは創業から一貫して、生命科学研究のデータ解析を通して研究成果を生み出すことや、研究成果…

ChIP-seqに代わる技術 CUT&RUN

CUT&RUN-seqをご存知ですか。 メリット、解析上の注意点を紹介します。(執筆・インターン生hattorit)

データ解析の学び方(雑談)

社員たちの会話@マスクランチ会

【CST、タカラバイオ、アメリエフ合同】CUT&RUNオンラインセミナー開催のお知らせ

新年明けましておめでとうございます。本年もどうぞよろしくお願いいたします。 さて、2021年1月22日 (金) 開催の、セルシグナリングテクノロジージャパン株式会社、タカラバイオ株式会社 、アメリエフ株式会社による合同オンラインセミナー「CUT&RUNによる…

あけましておめでとうございます

旧年中は格別のお引き立てをいただき、誠にありがとうございました。 特に旧年は、コロナ禍のため思うようにご研究ができなかった研究者の方もおられたかと思います。 弊社では今後もオンライントレーニングなど、時代に合わせたサービスを提供することで皆…

2020年振り返り

2020年を振り返ります。人材と、新しい技術やサービスが思い出されます。

【後編】保育園児2児を連れての、他市への引っ越しを経験して、振り返り!

アメリエフ社員の日常ブログ。引越しと保育園の転園を語ります。意外な制度があって預け先なしの危機も!?

推薦状ー

海外の大学院を受験するという元インターンシップ生に推薦状を書きました。

2020年分子生物学会年会バイテクセミナーで発表しました

日本分子生物学年会にて、入門者向けのセミナーを行いました(ででん!) 年会に参加登録した方は2021/01/29 まではアーカイブとしてご覧いただけます。

Pythonで全ゲノムFASTA=>染色体毎FASTAを作成してみた

全ゲノムFASTAだけでなく、染色体ごとのFASTAの入力が必要な解析ツールってありますよね🥺全ゲノムFASTAならある、、、そんな時はpythonですぐに作れます💫

データの大掃除はいかが?

眠ったままのデータはありませんか?アメリエフに相談して、気持ちよく年末を迎えましょう!

巨人の肩の上

先日はんこについての小学生の自由研究のニュースを見て、参考文献の書き方がしっかりして感心。 参考文献について考えてみました。

【レポート】「ショットガンメタゲノム解析Webinar~16S rRNA解析から進んだアプリケーションのご紹介~」オンラインセミナーで代表が講演しました

11月18日(水)に、理科研株式会社主催「ショットガンメタゲノム解析Webinar~16S rRNA解析から進んだアプリケーションのご紹介~」というテーマのオンラインセミナーにて、弊社代表の山口が講演させていただきました。 詳細はこちらからご覧いただけます ww…

Bedtools intersectに指定されたフォーマット以外のファイルを入力して,出力結果がおかしくなった話

これでできそう!と思っても結果をよく見てみると思ったのと違うこともある.横着せず,プログラムが指定するちゃんとしたフォーマットのファイルを入力しましょう

研究向け情報・製品・サービス発信プラットフォーム 「サイサチ受託カタログ」にアメリエフ社製品の掲載をスタート

アメリエフ株式会社(本社:東京都墨田区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ)は、2020年10月より、リカケンホールディングス株式会社が提供する製品情報サイト「サイサチ受託カタログ」(https://jutaku.saisachi.com/outsource/)に当社製品情報の掲…

【12/2(水)12時】”これからはじめる「シングルセルRNAseq」データ解析”オンラインセミナー

第43回 日本分子生物学会年会バイオテクノロジーセミナーで講演します。聴講後のアンケートに回答いただくことで、セミナー資料をダウンロードできます。 シン グルセルRNAseq解析の概要に加えて、データ解析のどのステップを外注して研究を効 率的にすすめ…

【レポート】「インフォマティクスで解き明かす農作物の状態〜一次産業での活用事例と応用可能性〜」オンラインセミナーを開催しました

10月14日(金)に、「インフォマティクスで解き明かす農作物の状態〜一次産業での活用事例と応用可能性〜」というテーマで、オンラインセミナーを開催しました。 セミナーでは、遺伝や環境情報をもとに作物の生産性向上を目指す生物計測学分野で活躍する東京…

snpEffとSnpSiftのfilter

SnpSift filterでsnpEffの複雑に見えるアノテーション結果をフィルタします。

pythonで重い計算の実行時間を減らす発想

pythonでloopのご利用は計画的に!

【レポート】DX(デジタルトランスフォーメーション)× 生命情報データ活用入門セミナーを開催しました

10月30日(金)に、「DX×生命情報データ活用入門」というテーマで、オンラインセミナーを開催し、多数の方にご参加いただきました。 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

misawatの社員褒め殺しシリーズ②

面と向かって感謝が伝えられない照れ屋なmisawatの自己満足企画第二弾! 今日紹介する社員はメディカルシステム事業部のエース、iijm-lさんです!

染まりゆく秋の情景に思いを馳せる 〜紅葉のメカニズム〜

(元)植物色素研究者が、この季節ならではの風景・紅葉のしくみについて解説!植物色素の科学って奥深いんです...🍁

21年卒内定式を開催したら、先輩からの熱心な回答で時間オーバーした!?

アメリエフでは、21年卒として、お二人の方をお迎えすることになりました。歓迎の気持ちを込めて、内定式を執り行いました。 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com