アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

Bioinformatics×Society 5.0 バイオエコノミーとは?【役員対談】

Society 5.0時代にアメリエフが目指すこと、について第2回目の役員対談をおこないました。 ご興味があれば、是非ご一読ください。 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

【プレスリリース】高校3年生から修士1年生を対象に 第2回「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催!

アメリエフは、高校3年生から修士1年生を対象に「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を、9月5日に開講いたします。 第2回目のテーマは「未病予防のための遺伝子解析超入門 -バイオインフォマティクス×Society 5.0-」です。 ご参加をお待ちしており…

食?

食(食べる方じゃないよ!)

バイオインフォマティクスをリモート講義で学習💻実際どんな感じ?

バイオインフォマティクスのトレーニングがオンラインに対応しました。本記事ではお客様目線でその流れをレポートします!

misawatの社員褒め殺しシリーズ①

技術部のなんちゃってトップであるmisawatがひたすら部下をほめます。 記念すべき第一回は、アメリエフブログの管理者でもあるゆるふわ氏です。

腸内古細菌っているの?

先日、16S rRNAの記事を書かせていただき、そこでもちょっと触れたのですが、 16S rRNAってRNAなの? - アメリエフのブログ 学生のころ、生物は(真正)細菌、真核生物、古細菌(アーキア)の3つに大別できる(3ドメイン説)と習ったので、『腸内「細菌」叢って…

サーバ間のファイル転送を手軽に!【.ssh/config ②】

scpコマンドって、ユーザー名指定して、IPアドレス指定して...ってコマンド長い!!そういう時も、.ssh/configが使えるんです😊 所要時間は1分⏱

PLINKで可能なファイル形式の変換

SNP解析をしていると、いろいろなソフトウェアでいろいろな形式のファイルが必要になってきますよね。 だいたいPLINKがどうにかしてくれます。

【sudo】rootパスワードを知らなくて困った話【su】

フットボール⚽️のリーグがおわり、観戦による寝不足から開放された筆者がお送りします! sudo とsuコマンドについて詳しく調べてみました🖥(取り扱い注意!)

マネージャーに聞いてみた、アメリエフのシステム開発の強みとは?

アメリエフには、データ解析やコンサルティングを担うライフサイエンス事業部と、システム開発を担うメディカルシステム事業部があります。 今回は、お客様からのご依頼のほか、自社製品開発や社内システムを担うメディカルシステム事業部マネージャーに、ア…

(Rで)オブジェクトの名前を文字列として取り出す。関数内でも使える

オブジェクト(変数)の名前って、ユーザにはもちろんわかるのですが、文字列として呼び出すのがけっこう難しいのです。今日はそんなやり方を紹介。関数の中に入れる場合の例も添えて! おまけ:納豆のはなし

Dockerfileを用いた初期設定:ユーザ追加

Dockerfileを用いたdockerイメージ生成、およびdockerイメージに対する設定をします。題材として、CentOS7のdockerコンテナにユーザを追加してみます。

【レポート】高校3年生から修士1年生対象 「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催しました!

6月27日(土)に開催したイベントレポートです。当日は、高校生の方や海外の学生の方まで、50名ほどの方にご参加いただきました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

Trinityを使った de novo transcriptome assembly + 発現比較

Trinityは de novo transcriptomeアセンブリングツールです。ここまでは有名(?)ですが、アセンブリ済みデータをリファレンスとして利用して、RNA-seqのマッピングや発現比較まで出来ちゃいます。

【役員対談】Bioinformatics×Society5.0 情報社会の次の社会とは?

Society 5.0時代にアメリエフが目指すこと、について役員対談をおこないました。 ご興味があれば、是非ご一読ください。 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

Macでターミナルとマウスを適度に使う 小技Best3

MacPCをターミナルのコマンド(bash)とマウスを組み合わせて操る、一流仕事術! (by "一流のほにゃほにゃ"がマイブームのブログ管理人 )

サーバへのログインを手軽に!【.ssh/config】

サーバへのログインって、ユーザー名指定して、IPアドレス指定して...ってめんどくさくないですか??そういう時は、.ssh/configを使いましょう😊 所要時間は3分⏱

joinコマンドで少し手間取った話

複数テキストファイル(表データ)をLinuxのjoinコマンドで連結する。おちいりやすい間違いとその対処も。

見積書を発行するまでの工程を大公開〜ラブレターのつくりかた〜

オーダーメイド性の高いサービスを提供しているアメリエフでは、見積書の発行までに多くの手間をかけています。いつも心に「顧客が求めていることはなんなのか」ーープロによる仕事を大公開!

Rのpchの種類

グラフのマーカーの色と形、使いこなしてみましょう

ディスプレイとノートPCの接触を良くするたった一つの方法

ディスプレイとノートPCの接触が悪かったとき。ありとあらゆるケーブルを挿し直して検証した結果・・・

【プレスリリース】高校3年生から修士1年生を対象に 「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開始!

課題解決型バイオインフォマティクス講座 アメリエフは、高校3年生から修士1年生を対象に「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を、6月27日に開講いたします。 第1回目のテーマは「個別化予防・医療のための遺伝子解析超入門 -遺伝子から個人の体質…

FileZillaの紹介/ファイルを正しいアプリで開く

「PNGをテキストエディタで開けるわけないでしょ!」 サーバとPC間でファイル転送する便利なアプリ"FileZilla" 簡単な紹介 と、筆者が遭遇した謎エラーの回避策。

docker超入門

dockerを使うと自分のサーバやPC内に独立した仮想環境を作ることができます。 起動やファイル移動などの使い方を簡単に紹介します。

5月7日は「博士の日」- 博士号取得支援制度を利用してみての体験談!

アメリエフでは、2年前より「博士号取得支援」制度がスタートしました! 5月7日の「博士の日」にかけまして、博士号取得支援制度を利用しているメンバーにインタビューしてみました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

読みやすいPythonコーディングを心がける

コーディング規約に従って、誰でも読みやすく理解しやすい、美しいコードを書きたい...!今日は、Pythonのコーディング規約「PEP8」について学びます👀💡

バイオインフォマティクス オンライン・トレーニングサービスを開始しました!

昨今の世界情勢を受け、多数ご要望を頂いておりました、オンライン・トレーニングサービスをスタートしました! amelieff.jp ビデオ会議システムを使って講義しますので、従来の訪問型トレーニングと同様、ご質問にその場でお答えしながら進めることができま…

16S rRNAってRNAなの?

メタゲノム解析でよく聞く16S リボソームRNAについて

簡単♪環境構築② Reseq環境を作ってみる編

Anaconda, Reseq, 環境構築

簡単♪環境構築① 入門編

AnacondaでYAMLファイルを使った簡単解析環境構築!YAMLファイルを解析環境の設計図のように用いて、複数のツールやパッケージを自動的にインストールできます。