アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

docker超入門

dockerを使うと自分のサーバやPC内に独立した仮想環境を作ることができます。 起動やファイル移動などの使い方を簡単に紹介します。

5月7日は「博士の日」- 博士号取得支援制度を利用してみての体験談!

アメリエフでは、2年前より「博士号取得支援」制度がスタートしました! 5月7日の「博士の日」にかけまして、博士号取得支援制度を利用しているメンバーにインタビューしてみました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

読みやすいPythonコーディングを心がける

コーディング規約に従って、誰でも読みやすく理解しやすい、美しいコードを書きたい...!今日は、Pythonのコーディング規約「PEP8」について学びます👀💡

バイオインフォマティクス オンライン・トレーニングサービスを開始しました!

昨今の世界情勢を受け、多数ご要望を頂いておりました、オンライン・トレーニングサービスをスタートしました! amelieff.jp ビデオ会議システムを使って講義しますので、従来の訪問型トレーニングと同様、ご質問にその場でお答えしながら進めることができま…

16S rRNAってRNAなの?

メタゲノム解析でよく聞く16S リボソームRNAについて

簡単♪環境構築② Reseq環境を作ってみる編

Anaconda, Reseq, 環境構築

簡単♪環境構築① 入門編

AnacondaでYAMLファイルを使った簡単解析環境構築!YAMLファイルを解析環境の設計図のように用いて、複数のツールやパッケージを自動的にインストールできます。

misawatの「適度にGASを使う」③

誰にも求められていn・・・ゲフンゲフン 。大好評を頂いている「適度にGASを使う」シリーズ第三段です。 関数を分けて書こう!の回。

reseq 解析超入門

「〇〇解析とは」シリーズ1。reseq解析 は、DNAの変異検出を目的とした解析です

【新入社員テレワークインタビュー第二弾】持ち前の「探求心」を活かして、研究者がより研究に集中できるシステムを作りたい!

アメリエフでは、この4月より新入社員として2名の方を迎えました。そこで今回は、入社されるまでの経緯やこれからやってみたいことなど、意気込みをインタビューしました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

macとlinuxのcatで不可視文字の確認

macOSのコマンドラインはLinuxのコマンドとよく似ており、割と気軽に操作を行うことが可能です。ですが、ちょっとしたコマンドがなかったり、オプションが違ったりします。先日、"cat"コマンドを使って不可視文字を確認するときに戸惑ったのでご紹介します。

簡単にコマンドの実行ログをファイルに記録する方法

Linuxコマンドの勉強を始めたばかりの方必見!コマンドの入力履歴や実行結果を、簡単にファイルへ出力する方法を2つ紹介いたします!

【新入社員テレワークインタビュー第一弾】コンサルティングやデータ解析へのアドバイスに、自分の経験を活かしていきたい!

アメリエフでは、この4月より新入社員として2名の方を迎えました。そこで今回は、入社されるまでの経緯やこれからやってみたいことなど、意気込みをインタビューしました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

遺伝子シンボルから遺伝子領域ファイル(BED)生成

「あれ?この遺伝子どこにあったっけ?」 遺伝子アノテーションソフト"SnpEff"の隠れた名機能、遺伝子シンボル ⇨ BED の変換について!

2020年度新卒入社しましたiijm-lです。

初めまして! 2020年の春に入社しました、iijm-lと申します。

2020年新入社員のh--ishiです

アメリエフ新入社員自己紹介(2020)

pca, tsne, umapの座標を書き出す

シングルセルRNA解析ソフトSeuratで、UMAP, tSNEなどのX, Y座標を取り出す方法です。書き出せばLoupe Browserなど他のソフトでも使えるようになります。

Windows同志のための:Macでコマンドライン環境を使う

こんにちは。Windowsユーザの筆者です。今週のお題「オンライン」にのっかって、初めてMacPCからサーバにssh接続するまでの思い出話。

協和キリン株式会社様 事例紹介ページを追加しました!

ライフサイエンス事業の事例紹介ページを、2件追加いたしました。 記事はこちらよりご覧いただけます。 ■ データ解析サーバ amelieff.jp ■ バイオインフォマティクストレーニング amelieff.jp

【インターン体験談】既存の「手法」を使って研究する立場から、「手法」自体を研究してみて新しい視点を持てた!

アメリエフではインターン生を募集しています! お蔭様でこれまで、たくさんの学生さんがインターンに参加してくださっています。 そこで今回は、アメリエフでのインターン体験談第6弾をお届けします。インターンをお考えの方のご参考になりますと幸いです。…

【前編】保育園児2児を連れての、他市への引っ越しを経験して、振り返り!

アメリエフ社員、引越しを語ります。入学前に引っ越しをすると前持っての手続きがいろいろ! 仕事もプライベートでもスケジューリングはばっちりなyama_toの体験談は必見♪

FastQCをたくさんかけたら・・・| FASTQのクオリティコントロール

クオリティコントロールを行う大人気ソフトウェア FastQC。結果をさくっと見るときに役立つファイルと短いコマンドを紹介します。

感染症対策にも対応。フレックス&リモートワーク

リモートワークの実運用について

3月2日より、新オフィスにて営業スタート!

こんにちは、yama_toです! 3月より、オフィスがスカイツリーの麓に移転しました。 お祝いを頂いた関係者の皆様へ、感謝申し上げます!! ありがとうございます! また、住所変更など事務手続き上、お手数おかけしてしまいますことをお詫び申し上げます。 今…

配色ツール

プレゼンのスライドづくりや、グラフの色の組み合わせでいつも悩むので、バランスの良い配色を教えてくれるWebツールを使ってみました。

FASTQをペアリードに分割する

ペアエンドリードのデータ を2つのFASTQファイルにする方法を紹介します。① SRAから②FASTQから

【インターン体験談】「社会に大きなインパクトを与えたい」という夢へのステップを知るため、アメリカからインターンに参加!

アメリエフではインターン生を募集しています! お蔭様でこれまで、たくさんの学生さんがインターンに参加してくださっています。 そこで今回は、アメリエフでのインターン体験談第5弾をお届けします。インターンをお考えの方のご参考になりますと幸いです。…

NGS解析と楽しい解析ログ

解析ログが楽しいソフトウェア2選!

空間的なトランスクリプトーム

spatial transcriptome の様々な手法①

Youtuberアメリエフ!!

この度、アメリエフはYoutuberとしてデビューしました!!