アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

Windowsユーザのためのあれこれ② -新しいPCを手に入れたら (GodModeのご紹介)

Windows PCのコントロールパネルを見やすくする

bamファイルのPPタグ

BAM/SAMファイルのヘッダーにある項目のひとつ「PP」タグについて説明します。エラー対処法も。

sedコマンドで染色体名を変更する

LInuxのsedコマンドでbedファイル内の染色体名を変更する方法

single cell RNA-Seqデータから コピー数変異を予測

がん細胞のシングルセルRNA-seq データからCNV コピー数変異を予測するプログラムの紹介です。図の見方も説明。

Rの%in%演算子とかmatch関数とか

Rの%in%演算子とmatch関数について紹介します

「"鍵"を閉める」とたまに耳にしますが、閉めるのは「錠」ですよね。

linux サーバーのユーザーアカウントを、パスワード認証で一時的にログインできなくさせる術

VCFファイルをPythonで扱う(cyvcf2の紹介)

VCFを分析できるPythonモジュール・cyvcf2の紹介です⭐️

Macのトラックパッドで単語を検索する

Mac

Macのトラックパッドで英単語を検索

Windowsユーザのためのあれこれ① -サーバ接続編

Windows PCを使ってサーバに接続してみよう

python : importで自分で書いたプログラムを使おう

pythonの`import`を用いると、パッケージを読み込んで様々な関数を使えます。 自分で定義した他のpythonプログラムもimportできます。長いプログラムを書くときや、機能別にファイルを分けたいときに便利!

2021年度新入社員のtsuyuhです。

自己紹介 (tsuyuh)

2021年度新卒 adachit

2021年に新卒入社したadachitの自己紹介

Reseq解析 2021アップデート

DNAの変異を検出するReseq解析の最新レビューを紹介。(筆・インターンtsuyuh)

迷子の♪迷子の♪ディレクトリさん

Linux入門講座でよくいただく質問「どこにどんなディレクトリを作ったかわからなくなっちゃったら,どうしたらいいですか?」にお答えします^^

鳥のしっぽ

Bowtie2のdovetail機能

退職のご挨拶

アメリエフ株式会社 CTO 退職のご挨拶

最先端の技術で、創薬やヘルスケアを発展させたいエンジニア集まれ!【役員対談】

新しい理療や新薬「開発」における、現場のニーズを叶えていく 取締役COO 金:エンジニアのマネージャー募集を始めた背景を教えてください。 代表 山口:アメリエフは創業から一貫して、生命科学研究のデータ解析を通して研究成果を生み出すことや、研究成果…

ChIP-seqに代わる技術 CUT&RUN

CUT&RUN-seqをご存知ですか。 メリット、解析上の注意点を紹介します。(執筆・インターン生hattorit)

データ解析の学び方(雑談)

社員たちの会話@マスクランチ会

【CST、タカラバイオ、アメリエフ合同】CUT&RUNオンラインセミナー開催のお知らせ

新年明けましておめでとうございます。本年もどうぞよろしくお願いいたします。 さて、2021年1月22日 (金) 開催の、セルシグナリングテクノロジージャパン株式会社、タカラバイオ株式会社 、アメリエフ株式会社による合同オンラインセミナー「CUT&RUNによる…

あけましておめでとうございます

旧年中は格別のお引き立てをいただき、誠にありがとうございました。 特に旧年は、コロナ禍のため思うようにご研究ができなかった研究者の方もおられたかと思います。 弊社では今後もオンライントレーニングなど、時代に合わせたサービスを提供することで皆…

2020年振り返り

2020年を振り返ります。人材と、新しい技術やサービスが思い出されます。

【後編】保育園児2児を連れての、他市への引っ越しを経験して、振り返り!

アメリエフ社員の日常ブログ。引越しと保育園の転園を語ります。意外な制度があって預け先なしの危機も!?

推薦状ー

海外の大学院を受験するという元インターンシップ生に推薦状を書きました。

2020年分子生物学会年会バイテクセミナーで発表しました

日本分子生物学年会にて、入門者向けのセミナーを行いました(ででん!) 年会に参加登録した方は2021/01/29 まではアーカイブとしてご覧いただけます。

Pythonで全ゲノムFASTA=>染色体毎FASTAを作成してみた

全ゲノムFASTAだけでなく、染色体ごとのFASTAの入力が必要な解析ツールってありますよね🥺全ゲノムFASTAならある、、、そんな時はpythonですぐに作れます💫

データの大掃除はいかが?

眠ったままのデータはありませんか?アメリエフに相談して、気持ちよく年末を迎えましょう!

巨人の肩の上

先日はんこについての小学生の自由研究のニュースを見て、参考文献の書き方がしっかりして感心。 参考文献について考えてみました。

【レポート】「ショットガンメタゲノム解析Webinar~16S rRNA解析から進んだアプリケーションのご紹介~」オンラインセミナーで代表が講演しました

11月18日(水)に、理科研株式会社主催「ショットガンメタゲノム解析Webinar~16S rRNA解析から進んだアプリケーションのご紹介~」というテーマのオンラインセミナーにて、弊社代表の山口が講演させていただきました。 詳細はこちらからご覧いただけます ww…

Bedtools intersectに指定されたフォーマット以外のファイルを入力して,出力結果がおかしくなった話

これでできそう!と思っても結果をよく見てみると思ったのと違うこともある.横着せず,プログラムが指定するちゃんとしたフォーマットのファイルを入力しましょう