Tera Termを便利に使ってみよう。
CNVの偽陽性を検出するCNVfilteR 論文紹介。仕組みをわかりやすくまとめ・インストール方法
venvで仮想環境構築
rcloneを使って、OneDriveのファイル・フォルダをLinuxサーバから参照する
シーケンスリードをゲノムにマッピングしたあと、カバレッジやデプスなどを簡単に確認する方法を紹介。samtoolsを使います。
SSH接続のタイムアウトを防ぐ
Rを使って、発現マトリックスに遺伝子の色々な情報を追記します。
Biopythonを使った「配列アライメントの実行」と「分子系統樹の描画」を紹介します💫
NGSデータから取得した変異データ(VCF形式)をGWAS解析のPLINKに読み込みます。
Windows PCのコントロールパネルを見やすくする
BAM/SAMファイルのヘッダーにある項目のひとつ「PP」タグについて説明します。エラー対処法も。
LInuxのsedコマンドでbedファイル内の染色体名を変更する方法
がん細胞のシングルセルRNA-seq データからCNV コピー数変異を予測するプログラムの紹介です。図の見方も説明。
Rの%in%演算子とmatch関数について紹介します
linux サーバーのユーザーアカウントを、パスワード認証で一時的にログインできなくさせる術
VCFを分析できるPythonモジュール・cyvcf2の紹介です⭐️
Macのトラックパッドで英単語を検索
Windows PCを使ってサーバに接続してみよう
pythonの`import`を用いると、パッケージを読み込んで様々な関数を使えます。 自分で定義した他のpythonプログラムもimportできます。長いプログラムを書くときや、機能別にファイルを分けたいときに便利！
自己紹介 (tsuyuh)
2021年に新卒入社したadachitの自己紹介
DNAの変異を検出するReseq解析の最新レビューを紹介。（筆・インターンtsuyuh）
Linux入門講座でよくいただく質問「どこにどんなディレクトリを作ったかわからなくなっちゃったら，どうしたらいいですか？」にお答えします^^
Bowtie2のdovetail機能
アメリエフ株式会社 CTO 退職のご挨拶
新しい理療や新薬「開発」における、現場のニーズを叶えていく 取締役COO 金：エンジニアのマネージャー募集を始めた背景を教えてください。 代表 山口：アメリエフは創業から一貫して、生命科学研究のデータ解析を通して研究成果を生み出すことや、研究成果…
CUT&RUN-seqをご存知ですか。 メリット、解析上の注意点を紹介します。（執筆・インターン生hattorit）
社員たちの会話＠マスクランチ会
新年明けましておめでとうございます。本年もどうぞよろしくお願いいたします。 さて、2021年1月22日 (金) 開催の、セルシグナリングテクノロジージャパン株式会社、タカラバイオ株式会社 、アメリエフ株式会社による合同オンラインセミナー「CUT&RUNによる…
旧年中は格別のお引き立てをいただき、誠にありがとうございました。 特に旧年は、コロナ禍のため思うようにご研究ができなかった研究者の方もおられたかと思います。 弊社では今後もオンライントレーニングなど、時代に合わせたサービスを提供することで皆…
