アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

知らないとおじさん?なLinuxコマンド 3選【もう古い】

巷で噂の知らないとおじさん?なLinuxコマンドをまとめました。Linuxエンジニアとしては、最新のLinuxコマンドやオプションを随時アップデートしたいものです。

Seleniumでスクレイピング

PythonライブラリのSeleniumでスクレイピングを行う方法を細かく解説します。情報収集や業務効率化に役立ちます!

rcloneでGoogleドライブの"共有ドライブ"からLinuxサーバにファイルを移動する

rcloneを使ってLinuxサーバから直接Googleドライブを参照します。

会社ブログの編集者に10の質問☆

はてなブログ10周年特別お題「はてなブロガーに10の質問」 10周年おめでとうございます!編集者Fが勝手に答えます🎁

Sambaでローカル・サーバ間の共有ディレクトリを作成する

Sambaのインストール、confの書き方まで共有ディレクトリの作成方法を大解説!

LiftoverVcfでVCFのゲノムビルドを変換する

GATK liftoverVcfでVCFのゲノムビルドを変換する方法です

Rで重複しないrownamesを作る

統計解析ソフトRで、重複した文字列に『異なる名前を割り振って重複しないようにする方法』を紹介します。行名をつけるときによく使えるかも(^-^)!

ヘッダファイルが見当たらないエラーを解決しよう【環境構築あるある】

環境構築でよく見るあの子(エラー)に出会っちゃったときの対処法を紹介しました✨

Windowsユーザのためのあれこれ③ -Tera Termの基本操作・設定

Tera Termを便利に使ってみよう。

CNVの偽陽性を検出するCNVfilteR

CNVの偽陽性を検出するCNVfilteR 論文紹介。仕組みをわかりやすくまとめ・インストール方法

venvでPython仮想環境を構築

venvで仮想環境構築

rcloneでOneDriveからLinuxサーバにファイルを移動する

rcloneを使って、OneDriveのファイル・フォルダをLinuxサーバから参照する

samtools coverage

シーケンスリードをゲノムにマッピングしたあと、カバレッジやデプスなどを簡単に確認する方法を紹介。samtoolsを使います。

SSH接続のタイムアウトを防ぐ〜ローカル側の設定

SSH接続のタイムアウトを防ぐ

Rで遺伝子名をIDに変換する

Rを使って、発現マトリックスに遺伝子の色々な情報を追記します。

Pythonで配列アライメントおよび分子系統樹を書く

Biopythonを使った「配列アライメントの実行」と「分子系統樹の描画」を紹介します💫

PLINKにvcfを読み込む方法

NGSデータから取得した変異データ(VCF形式)をGWAS解析のPLINKに読み込みます。

Windowsユーザのためのあれこれ② -新しいPCを手に入れたら (GodModeのご紹介)

Windows PCのコントロールパネルを見やすくする

bamファイルのPPタグ

BAM/SAMファイルのヘッダーにある項目のひとつ「PP」タグについて説明します。エラー対処法も。

sedコマンドで染色体名を変更する方法

LInuxのsedコマンドでbedファイル内の染色体名を変更する方法

single cell RNA-Seqデータから コピー数変異を予測

がん細胞のシングルセルRNA-seq データからCNV コピー数変異を予測するプログラムの紹介です。図の見方も説明。

Rの%in%演算子とかmatch関数とか

Rの%in%演算子とmatch関数について紹介します

「"鍵"を閉める」とたまに耳にしますが、閉めるのは「錠」ですよね。

linux サーバーのユーザーアカウントを、パスワード認証で一時的にログインできなくさせる術

VCFファイルをPythonで扱う(cyvcf2の紹介)

VCFを分析できるPythonモジュール・cyvcf2の紹介です⭐️

Macのトラックパッドで単語を検索する

Mac

Macのトラックパッドで英単語を検索

Windowsユーザのためのあれこれ① -サーバ接続編

Windows PCを使ってサーバに接続してみよう

python : importで自分で書いたプログラムを使おう

pythonの`import`を用いると、パッケージを読み込んで様々な関数を使えます。 自分で定義した他のpythonプログラムもimportできます。長いプログラムを書くときや、機能別にファイルを分けたいときに便利!

2021年度新入社員のtsuyuhです。

自己紹介 (tsuyuh)

2021年度新卒 adachit

2021年に新卒入社したadachitの自己紹介

Reseq解析 2021アップデート

DNAの変異を検出するReseq解析の最新レビューを紹介。(筆・インターンtsuyuh)