アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

【シングルセル解析】サンプル間で共通するマーカー遺伝子の検出方法

シングルセル解析パッケージ Seurat の FindConservedMarkers() 関数を用いて、異なるサンプルで共通しているマーカー遺伝子を調べる方法について説明!

TrimmomaticによるBGISEQデータのアダプター配列除去方法について

BGIシーケンサーデータに対する問い合わせが増えてきたため、Trimmomaticを使ってアダプター配列除去を行う方法をお教えします。

Reactome において第二階層のパスウェイを検索する方法

Reactome のデータを使うことで、第二階層のパスウェイを検索する方法を紹介!

Excelファイルをrcloneで転送する際に困った話

rcloneを使ったExcelファイルの転送には注意が必要

Rパッケージの付属データの確認方法

irisがおなじみ、Rの標準データセットや、インストールしたパッケージごとの付属データセットを確認する方法を紹介します。これで新しいパッケージの動作確認もらくらく!?

Volcano Plot を綺麗に描きたい

R パッケージ EnhancedVolcanoを用いて、Volcano Plot を綺麗に描く方法をご紹介します。

EBSeqの使い方(三群以上の多群比較)

RNA-seqのデータから発現変動遺伝子(DEG)を経験ベイズモデルで検出するプログラムEBSeqの紹介です。多群比較においてDEGを検出する考え方と方法を丁寧に紹介します。