アメリエフの技術ブログ

Amelieff Staff Blog

PLINKで可能なファイル形式の変換

SNP解析をしていると、いろいろなソフトウェアでいろいろな形式のファイルが必要になってきますよね。 だいたいPLINKがどうにかしてくれます。

【sudo】rootパスワードを知らなくて困った話【su】

フットボール⚽️のリーグがおわり、観戦による寝不足から開放された筆者がお送りします! sudo とsuコマンドについて詳しく調べてみました🖥(取り扱い注意!)

マネージャーに聞いてみた、アメリエフのシステム開発の強みとは?

アメリエフには、データ解析やコンサルティングを担うライフサイエンス事業部と、システム開発を担うメディカルシステム事業部があります。 今回は、お客様からのご依頼のほか、自社製品開発や社内システムを担うメディカルシステム事業部マネージャーに、ア…

(Rで)オブジェクトの名前を文字列として取り出す。関数内でも使える

オブジェクト(変数)の名前って、ユーザにはもちろんわかるのですが、文字列として呼び出すのがけっこう難しいのです。今日はそんなやり方を紹介。関数の中に入れる場合の例も添えて! おまけ:納豆のはなし

Dockerfileを用いた初期設定:ユーザ追加

Dockerfileを用いたdockerイメージ生成、およびdockerイメージに対する設定をします。題材として、CentOS7のdockerコンテナにユーザを追加してみます。

【レポート】高校3年生から修士1年生対象 「課題解決型バイオインフォマティクス講座」を開催しました!

6月27日(土)に開催したイベントレポートです。当日は、高校生の方や海外の学生の方まで、50名ほどの方にご参加いただきました! 記事はこちらからご覧いただけます www.wantedly.com

Trinityを使った de novo transcriptome assembly + 発現比較

Trinityは de novo transcriptomeアセンブリングツールです。ここまでは有名(?)ですが、アセンブリ済みデータをリファレンスとして利用して、RNA-seqのマッピングや発現比較まで出来ちゃいます。