アメリエフのブログ

Amelieff Staff Blog

2013-11-26から1日間の記事一覧

第27回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるゲノム解析@神戸」満員御礼

第27回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるゲノム解析@神戸」はお申込みが定員に達しましたのでキャンセル待ちとさせていただいております。 たくさんのお申込み、ありがとうございました!

Somatic Mutation検出ツール

Somatic Mutationを検出する主なツールを紹介します。 腫瘍サンプルと正常サンプルのBAM/Pileupファイル、リファレンスゲノムのFASTAファイルが入力ファイルとして必要です。 ・VarScan2(2012) 入力ファイルは、BAMファイルをSAMtoolsでPileupファイルに変換…