NGSデータ解析勉強会の準備中
今週末23日(土)に行われる「バイオインフォマティクス勉強会 次世代シーケンサーのデータ解析入門」の準備をしています。
おかげさまで増席後も満席となっておりますので、期待の大きさに少々プレッシャーを感じつつも、自分たちが行っているNGSのデータ解析のフローを簡単にではありますがご紹介したいとおもいます。
また、その際の簡易的なスクリプトもお持ち帰りいただいて、ご利用いただけたらと考えております。
私が学生時代にゲル板でシーケンシング(といえるかわかりませんが)をしていた頃は、3日間の実験で100bpとかそのオーダーでした。
それが今や、NGS1台を1週間ランさせるだけ(ラン途中の大半の時間は放置ですし)で、100Gbpのオーダーで配列が読めるわけですから。時間や精度を買っていると考えられますね。
歳をとると昔話が多くなってしまいます。(笑)
いかん・いかん。
身も心も若くいたいとおもっていますが、皇居周辺を9kmほどランニングしただけで、2日間筋肉痛です。(-_-;)
脳みそも肉体も鍛錬が必要ですね。
おかげさまで増席後も満席となっておりますので、期待の大きさに少々プレッシャーを感じつつも、自分たちが行っているNGSのデータ解析のフローを簡単にではありますがご紹介したいとおもいます。
また、その際の簡易的なスクリプトもお持ち帰りいただいて、ご利用いただけたらと考えております。
私が学生時代にゲル板でシーケンシング(といえるかわかりませんが)をしていた頃は、3日間の実験で100bpとかそのオーダーでした。
それが今や、NGS1台を1週間ランさせるだけ(ラン途中の大半の時間は放置ですし)で、100Gbpのオーダーで配列が読めるわけですから。時間や精度を買っていると考えられますね。
歳をとると昔話が多くなってしまいます。(笑)
いかん・いかん。
身も心も若くいたいとおもっていますが、皇居周辺を9kmほどランニングしただけで、2日間筋肉痛です。(-_-;)
脳みそも肉体も鍛錬が必要ですね。