BWAの最新バージョンはv0.6.1ですが（2012年6月現在）、まだv0.5.x系をお使いの方も多いのではないでしょうか。 BWA v0.5.x系とv0.6.x系で何が違うかまとめてみました。 ■BWA v0.6.xの変更点 ・4GB以上のゲノムに対応 ・ForwardとReverseのインデックスを統…