エンリッチメント解析
本記事では、前編で準備したairwayデータを用いて、**ORA(Over-Representation Analysis)とGSEA(Gene Set Enrichment Analysis)**の実行例と可視化方法を紹介しています。RのclusterProfilerパッケージを中心に、enrichGOとgseGO関数を用いた解析を行い…
本記事では、R環境でのGSEA(Gene Set Enrichment Analysis)解析の実践的な流れを、airwayパッケージの公開データを用いて丁寧に解説しています。ヒト気道平滑筋細胞に対するステロイド処理の有無による発現変動をDESeq2で解析し、その結果をもとにエンリッ…