バイオインフォマティクス入門
RNA-seqデータ解析成功の鍵は前処理にあり。FastQCでの品質評価、PRINSEQによる低品質リード除去、STARでのゲノムマッピングまで、実践的な手法と成功のポイントを解説します。
RNA-seq解析の有効なケース、メリット・デメリット、データ取得から機能解析までの全体像を解説。適切なツールと解析環境の重要性も示し、RNA-seq解析の基礎を網羅的に理解できます。
PythonのPandasライブラリで表形式データを効率的に操作する方法として、データ読み込み、表示、統計量取得など、データ解析の基礎を解説します。
Windows上でのPythonとJupyter Notebookのセットアップや、BioPythonを導入してFASTA形式の塩基配列データを読み込む基本的な方法を解説します。
統計解析ソフトRでのデータハンドリング(データ取得、Rへの読み込み)から、Bioconductorのインストール方法まで解説します。
統計解析ソフトRでのデータ操作と可視化を解説。関数電卓としての利用や、散布図・ヒストグラム作成の基礎を解説します。
バイオインフォマティクスを独学で学ぶ方に向け、統計解析ソフトRの各OSでの動作や実行環境の選び方、Rの基本をご紹介します。