GO解析結果の可視化について実践的に解説します。RNAseq由来の遺伝子セットに対するエンリッチメント解析を題材に、Upset plotやGSEA plotなど多様な図の作成方法を紹介。必要なパッケージやエラー対応も丁寧に説明し、再現性を意識した内容となっています。

RNA-seqデータ解析における遺伝子発現定量と主要なデータ可視化手法とは。発現定量、正規化、主成分分析、階層的クラスタリングを通し、高次元データから生物学的知見を引き出す方法を解説します。

Python の scikit-learn を使い、糖尿病データセットで回帰分析を行う方法を解説します。データ確認からモデル評価まで、一連の機械学習の流れを紹介する入門記事です。

RNA-seqデータ解析成功の鍵は前処理にあり。FastQCでの品質評価、PRINSEQによる低品質リード除去、STARでのゲノムマッピングまで、実践的な手法と成功のポイントを解説します。

ヒト細胞アトラス「Tabula Sapiens」の膨大なデータをコマンドラインで効率的に解析！CELLxGENE Censusを使い、特定の遺伝子発現をPythonで可視化する手順を解説します。

GO解析結果の可視化について実践的に解説します。enrichplotを用いて、RNAseq由来の遺伝子セットに対するエンリッチメント解析を多彩な図で表現。エラー対応や再現性の工夫も交え、研究者が自分の環境で再現できるよう丁寧に紹介しています。

RNA-seq解析の有効なケース、メリット・デメリット、データ取得から機能解析までの全体像を解説。適切なツールと解析環境の重要性も示し、RNA-seq解析の基礎を網羅的に理解できます。

GO解析結果の可視化について実践的に解説します。RNAseqデータから得られた遺伝子セットに対するエンリッチメント解析の基本から、DOSE・enrichplotパッケージを用いたRでの可視化手法まで、コマンドの意味やデータ構造の確認を丁寧に紹介。研究者が自分のデ…

こんにちは、受託コンサルティングチームの hosor です。 Mountpoint for Amazon S3 は、Amazon S3 バケットを、Linux 上のディレクトリのように扱うことができるツールです。 通常、S3 とのファイルのやり取りは AWS CLI などの専用コマンド等を使う必要が…

PythonのPandasライブラリで表形式データを効率的に操作する方法として、データ読み込み、表示、統計量取得など、データ解析の基礎を解説します。

R関連の技術書を実体験を交えて紹介します。初学者向けから中級者向けまで、Rの基本操作やtidyverse、データサイエンスの実践的な内容を網羅。学習スタイルやコマンド実行の工夫にも触れ、読者が自分に合った方法で継続できるよう丁寧にまとめています。

バイオインフォマティクスで便利な Linux コマンド 10 選。ファイル破損確認、圧縮ファイル閲覧、バックグラウンド実行など、作業効率化のコツを紹介します。

Windows上でのPythonとJupyter Notebookのセットアップや、BioPythonを導入してFASTA形式の塩基配列データを読み込む基本的な方法を解説します。