UCSC Genome Browserの「GRCh38/hg38」にかっこいいトラックを見つけたのでご紹介します。
「RepeatMasker Viz.」というトラックです。
下図の上がRepeatMaskerトラック、下がRepeatMasker Viz.トラックです。
RepeatMasker Viz.はRepeatMaskerを視覚的に表示したトラックです。
矩形の部分はゲノムにマップできる部分、破線の部分はマップできない部分で、リピート中のInDelも表示できます。
Repeatの様子が理解しやすくていいですし、数字の入れ方など見た目がなんかかっこいいです。
詳しくは Repeats -> RepeatMasker Viz. のヘルプをご覧ください。
