SNP・GWAS解析ソフト「QuickGWAS Academic」を使用して解析を行います。
解析は、Preparation→GWAS→Plotの順番で行います。
Preparationが完了したら、GWASを行います。
step1
「GWAS」タブを選択します。
step2
「.bed」「.bim」「.fam」ファイルを指定します。
step3
マイナーアリル頻度（MAF）とハーディー・ワインバーグ平衡（HWE）を、プルダウンメニューから指定します。
step4
「Execute GWAS」ボタンをクリックして、GWASを実行します。
step5
成功すると「GWAS End」ウィンドウが表示され、サンプル数が表示されます。
step6
「view log」をクリックすると、PLINKのログをご覧いただけます。
【ダウンロードページはこちら】
「QuickGWAS Academic」のQuickGWASAcd_1.1.0.zip Version 1.1.0 (update: 2011/01/17)をクリックしてください。
