以前、BEDToolsについて簡単にご紹介しました。
「BEDファイル」とはどんなファイルなのか、続きを書きたいと思います。
ファイルに記入できる情報以下の通りです。
１．chrom
２．chromStart
３．chromEnd
４．name
５．score
６．strand
７．thickStart
８．thickEnd
９．itemRgb
１０．blockCount
１１．blockSizes
１２．blockStarts
最初の3列は必須の情報です。
向きを指定したい場合は6列目まで、色を指定したい場合は9列目まで入力する必要があります。
