すら(SRA)っとクイック(Q)に変換
NCBI SRAからダウンロードしたファイルがsraフォーマットの場合、以下のコマンドでまとめてfastqに変換すると便利です。
$ find . -name '*.sra' -exec fastq-dump {} ¥;
fastq-dumpについては
NCBI SRA Toolkitの使い方
も、findコマンドについては
findの-execオプション
もご覧ください。
NCBI SRAからダウンロードしたファイルがsraフォーマットの場合、以下のコマンドでまとめてfastqに変換すると便利です。
$ find . -name '*.sra' -exec fastq-dump {} ¥;
fastq-dumpについては
NCBI SRA Toolkitの使い方
も、findコマンドについては
findの-execオプション
もご覧ください。