IGVは、米Broad Instituteによって作成されたゲノムブラウザです。
Javaで作成されているので、使用する際はJavaをインストールしておく必要があります。サイトはこちらです。
画面はこんな感じです。
魅力的な点は、
１．複数のファーマットに対応
２．インターフェースが直感的
３．クローズドの環境で使える
でしょうか。
１．複数のファーマットに対応
GFF,WIG,BED,FASTAなど、なんと26種類ほどのファーマットに対応しています。
２．インターフェースが直感的
染色体のアウトラインを、マウスでがしがしスピーディーに動かせるのでストレスフリーです。
３．クローズドの環境で使える
データが流出する心配がないので、セキュリティの面では安心かと思います。
あらかじめいくつかのアノテーションが登録されています。
あとは、必要なアノテーションを準備すれば快適にご使用いただけると思います。
