今回のテーマは「GWASの解析結果をIGVで見ましょう」です。
これまで、
1.ダウンロード
2.起動
3.CNファイル入力
を行いました。
入力したファイル(mynah.sorted.cn)は、縦に238304SNP、横に2つの解析結果(SNPごとのP値)が並ぶファイルでした。
今日は、データを見やすく表示させたいと思います。
画面操作については、こちらをご覧ください。
step1
対象を選択します。
ふたつのサンプルを選択するには、
・サンプルパネルのサンプルを「Ctrl」+クリック
・属性パネルのカラーバーを右クリック
する方法があります。選択されたサンプルは灰色になります。
step2
設定を行います。
対象を選択した状態で右クリックします。
下記の図の通り、チェックや設定を変更します。
さらに、メニューバーの「View」をクリックして、「Preferences...」を選択します。
「Charts」タブの「Label Y Axis」をチェックします。
このように表示されました。
お好みで調節してください。